额勒登保担任经略以后，大权在手，就统筹全局，让文职人员写了份报告，上报说：
我这几年一直担任一路军的剿匪工作。现在被选为经略，就应该通筹全局。教匪本来是内地的土老百姓，应该用招抚的办法来瓦解他们，然后必定能先围剿再安抚，或者先围堵再围剿。从前湖北教匪多，胁从少，四川教匪少，胁从多。现在，湖北的反贼都跑到四川了，其余和川东、巫山、大宁接壤的，因为有许多山作为凭借，所以湖北重在堵而不在剿。到了川陕交界，从广元到太平千余里，随处可通，陕西攻打得紧就会逃回四川，四川攻打得紧就会逃回陕西，所以汉江南北，应该剿堵并重。
川东、川北，有嘉陵江来阻它的西南部，其余崇山峻岭，居民大部分依山傍水，一直没有村落，这些地方可以安营扎寨，进行剿灭。川北的情况更有利，完全可以把反贼逼进山沟里剿灭，所以四川重在剿而不在堵。虽然敌人不一定会聚到一块儿，但只要我军步步为营，稳扎稳打，肯定会事半功倍。这三省的情况差不多。我已经通知下去了，也建立了赏赐处罚的标准，就等着官民同心，官兵一致，一起剿灭敌人。我一定和士兵在一起，团结一致，万众一心，和各个部队相互协作。害怕皇上太过担心，所以报告给您。
这份规划确实不错，所以部队渐渐开始有起色。正好德楞泰追逐徐天德，转战陕西时跟高均德等相遇，便乘着大雾袭击高均德，把他抓住了，于是朝廷下令任命德楞泰为参赞大臣。高均德死后，没想到又冒出一个冉天元，收集高均德的残余势力，跟徐天德联合，非常厉害。
额勒登保亲自去监督围剿，让杨遇春率领左翼，穆克登布率领右翼。穆克登布也是一员骁将，但和杨遇春关系不太融洽。杨遇春因为冉天元非常善战，不能和其他反贼同日而语，于是提议用全部兵力把他打败，然后再分兵追击。额勒登保也赞成这个办法，只有穆克登布不以为然。
到了苍溪，穆克登布听说跟冉天元离得很近了，竟然急功冒进，绕到冉天元前面。忽然伏兵齐起，前后夹攻，将穆克登布给围住了。穆克登布奋力冲突，仍然不能突破包围圈。幸亏民兵帮忙，穆克登布这才被救出，将士伤了不少。穆克登布经过这次挫折，大家都以为他会谨慎一些了，没想到他依然如故，仍然奋力追冉天元。跑到老虎垩，旁边有座大山，穆克登布一马当先，占领了山顶。杨遇春占住山腰。冉天元正埋伏在山中，先去攻打杨遇春的部队。
杨遇春坚守不动，冉天元无可奈何。又去攻打穆克登布，冒死突上。山顶狭窄，任你穆克登布如何骁勇，也施展不开。冉天元进一步，穆克登布就退一步，越逼越紧，穆克登布的营帐也从山上掉下去了，顿时军中大乱，副将死了十几名，士兵死了不计其数。
右翼军失败，冉天元再去攻打左翼军，杨遇春拼死力战。从傍晚杀到天明，冉天元这才撤退。杨遇春的部下也伤亡了很多，额勒登保非常愤怒，就命令德楞泰去夹击冉天元。
没想到川北的王廷诏一股，竟然从川北跑到了汉中，企图进入甘肃。额勒登保得到报告，立刻带兵连夜去支援，又让德楞泰随后策应。冉天元又东渡嘉陵江，分别进犯潼川、锦州、龙安，将要和甘肃反贼会合。
川陕甘一带，同时告警。清政府不得已，仍然让明亮担任领队大臣赶赴湖北，赦免了勒保的罪，让他担任四川提督，赶赴四川。并下令让德楞泰回截冉天元，任命他为成都将军。
德楞泰奉命回南方，打听到冉天元在江油县，立刻从小路去攻打。冉天元层层设伏，德楞泰步步为营，十荡十决，连夺险隘，转战马蹄岡。这时已经到了傍晚，德楞泰见伏兵渐渐少了，正打算下马休息一下，突然看见东北角升起一支烟火。德楞泰大惊失色：“我们中埋伏了。”话还没说完，西北角也跟着升起一支烟火。
德楞泰急忙让士兵排开队伍，分头迎敌。转身一看，西南角和东南角上也都闪着火光。火光冲天四起，马声杂乱，人声鼎沸。德楞泰猜想伏兵不止一二路，立刻分成四路抵御，刚布置完毕，敌兵已经由远及近，差不多有七八路。德楞泰下令让一块儿放枪，放了一阵，敌兵毫不退怯，反而渐渐围上来。德楞泰看见敌人都拿着竹竿子，竿子上绑着湿布，箭和枪打在上面根本没什么效果。敌人仍然前进，德楞泰只好下令让士兵各自为战。
官兵深陷重围，知道没什么活路，都开始拼命。血战了一夜，敌人仍然不退，又打了一天，敌人才稍稍退去。官兵赶紧埋锅做饭，刚吃了饭，敌人又围上来了，又是一天一夜，官兵只吃了一顿饭。德楞泰暗想：“敌人轮流来攻打我们，我们如果没有援军，肯定会全军覆没。”于是，下令边打边跑。
官兵阵势一动，冉天元就知道他们是想逃跑，急忙带兵去追。追得慢的教匪都被自己的头目给杀死了，所以不得不舍命追赶。官兵打了三日三夜，早就没力气了，肚子又饿，没办法，只好纷纷溃散。德楞泰也觉得人困马乏，就带着几十名亲兵跑到了山上。他下马喘了口气，说：“我从参军以来，还没见过这么心狠手辣的土匪，这回看来是要死在这里了。”正在自言自语的时候，猛听见一声大喊，说：“德楞泰哪里走？”这一声响彻山谷。
德楞泰急忙上马观察，就看山下一人挥着鞭，舞着刀，冲上来。这人正是冉天元。德楞泰早就打好了死的谱，也不害怕了，又看见走上来的只有冉天元一个人，胆子更壮了，就也大喊说：“姓冉的贼！你别欺人太甚！来送死是吗？”一面说话，一面拈弓搭箭，飕的一声，正好射中冉天元的马。那马一痛，一尥蹶子，把冉天元掀掉了，骨碌碌地滚下山去。德楞泰急忙拍马下山，亲兵也紧随而下，就看见冉天元正挂在断崖藤上，德楞泰忙从亲兵手中抢过钩头枪，把冉天元钩来，扔在地上，亲兵上来把他绑起来。
山下的兵，正要上山接应冉天元，看见冉天元被捉，急忙拼命来夺。德楞泰又去交战，忽然山后冒出一支人马，翻过山来，从山顶冲下。德楞泰仔细一瞧，原来是山后的民兵。敌兵一看民兵到了，转身就跑。德楞泰带着民兵一连追出去二十里路。川西肃清，川东北虽有余孽，也不足为患。正好勒保到了四川，就把肃清余党的事，交给了勒保，自己去赶赴额勒登保的部队了。
额勒登保追拿王廷诏，沿途也多有斩获。王廷诏又从甘肃返回陕西，那彦成因为堵剿不力，被上面狠狠地批评了一顿。恰好河南布政使马慧裕在叶县抓住了白莲教教主刘之协，把他送到京城。刘之协立即就被处死了。朝廷又通知军机大臣说：
据马慧裕报告说，宝丰、郏县有匪徒闹事，不久在叶县抓获了首犯刘之协。白莲教的匪徒也都全部被剿灭，又让白莲教的头目确认，确实是刘之协本人。刘之协是教匪首脑，造反作乱，荼毒生灵，实在可恨。
幸亏上天保佑，父皇在天有灵，终于将教匪消灭殆尽。可见教匪劫数已尽，从此各路大兵，一定能尽快扫除余孽。我在欣慰之余，又觉得有些不忍，因为这些教徒本来都是良民，就是因为刘之协的蛊惑，这才被蒙蔽了。
到现在清剿白莲教已经进行了好几年了，不管是无辜的百姓，还是真正的白莲教教徒，都是我大清的子民，只因为一时愚昧，这才导致犯了重罪。各路贼头凡是被杀的都是受了极刑，虽然罪有应得，但也是因为受了刘之协的蛊惑造成的，虽然他们的顽固很可恶，他们的愚昧也很可怜。我看在苍天有好生之德，就放宽政策。现在命令经略额勒登保、参赞德楞泰、各路带兵大员与各督抚等人，将刘之协擒获的事，广泛宣传，并通知贼营，你们的头脑已经被灭了，不要再执迷不悟了。只要不再跟着瞎搅和，我们都会妥善安置。如果我的通知传达下去，仍然怙恶不悛的，那就只有被处死的份儿了。额勒登保等人要鼓励将士，尽快扫平反贼，安顿百姓。我等着一块儿给你们奖赏。特此通知。
嘉庆帝又亲自写了一份关于邪教的论文，这大概是最早的论文了。从此这帮反贼没了头脑，也渐渐转过头皮，开始做良民了。这时的巨寇，只有王廷诏在陕西，徐天德在湖北。德楞泰从四川赶到陕西和额勒登保合军，追袭王廷诏。杨遇春为先锋，到了龙池场，分兵埋伏，引诱王廷诏追来，一举捉住，并抓获小头目十几人。剩下的教匪到逃到了湖北，由德楞泰带兵追剿，和明亮夹击，在均州围攻徐天德、樊人杰。徐天德、樊人杰先后都跳河自杀了。川鄂陕三省的头目也都消灭殆尽了，不过还有漏网之鱼。这时，已经是嘉庆六年的夏天。
究竟后事如何，咱们下章再讲。