和珅伏诛的时间，正是王三槐到了京城的时候。嘉庆帝就让军机大臣审问王三槐，只审问出“官逼民反”四个字。等到嘉庆帝亲自审问，也仍然是这四个字。嘉庆帝就问：“四川就没有一个好官员了吗？”王三槐说：“只有刘青天一人。”嘉庆帝问：“怎么个刘青天？”王三槐说：“就是现在任职建昌道台的刘清。”嘉庆帝又问：“只有一个刘青天吗？”王三槐说：“除了刘青天，要算巴县老爷赵华、渠县老爷吴桂，虽然比不上刘青天，但还算是好官，其他就没有了。”嘉庆帝听了这话，非常感慨。就让人把王三槐关进大牢，但先不要用刑。又下了一道命令说：
我们国家能够传承百年，百姓安居乐业，除非万不得已，谁会抛家舍业，铤而走险？都是因为州县的官员巴结上司，上司巴结和珅，现在和珅已经伏法，朝政已经清明。底层的民情能够被上级知道，以后就不会再使人民受损了。
因为教匪逼迫良民，百姓遇到官兵又被驱赶到前方抵挡教匪，还害怕他们逃跑，让他们剪掉头发，刺了脸面，老百姓进退都是死，我日日夜夜都在心疼他们。从来用兵打仗都是针对敌人，实在没想到现在会针对我的人民。我现在下令，有可以抓到贼头的不仅没罪，还有奖赏，那些自动脱离教匪的也不用追究责任。
根据王三槐的供词，四川的好官，除了刘清以外，还有知巴县的赵华、知渠县的吴桂，这些人应该予以提拔，给老百姓一个交代。至于达州知州戴如煌，贪污腐败，借着剿灭邪教的名义，拘捕一些富户，而贼头徐天德、王学礼也都是因为行贿逃跑的，弄得民怨沸腾。而武昌府同知常葵，奉命捉拿教匪，却牵连无辜百姓几千人，还一再勒索，导致聂人杰拒捕闹事，都给我抓到京城治罪。
难民有无家可归的，就让刘清帮着一块儿安顿。可以仿效明代项忠、原杰的办法，来招抚各处的流民，按实际情况处理吧。
一定要通知到四川、河南、湖北、陕西的各个地方，让老百姓都知道我的心思。
这道命令下达以后，各处的官员这才知道，嘉庆帝一直很留心外省的事情，不是一点也不知道。而且命令里所表露出来的慈悲恻隐之心，真不愧被谥为仁宗。各路的将帅也不能一下子全换，嘉庆帝就逐渐地改换。
之后又下了几道命令，记录如下：
以前和珅把持朝政，导致各路带兵的大臣依靠和珅的蒙蔽，冒领功绩，浪费军饷，大都不以实报告。现在更换将帅，但一时找不到那么多合适的人代替，就仍然让勒保担任经略大臣，四川、陕西、湖北、河南的官员都由他来管理。任命明亮和额勒登保为参赞大臣，令他们各自率领部队抵挡一路，有不遵守命令的，要以实报告。
四川、湖北的军费三年已经花了七千多万，这是以前从来没有过的事。这是因为，许多官员仗着和珅保护，像福康安和和琳一样，在部队笙歌燕舞，导致国家财产任由他们浪费，而各地民兵的军饷却迟迟不发。坏毛病起源于毕沅在湖北，然后宜绵、英善在四川也跟着这么干。以后不准再有这种情况，一旦抓到，严厉处置。
宜绵先后多次报告，都只是驻扎在没有反贼的地方，从来没跟贼打过一回仗，而且他已上了岁数，就让他缷任到京城来吧。
惠龄也一直没有功劳，被反贼瞧不起，也让他回京。景安是和珅的族孙，平时就依附和珅，每次报告也都听从他的指使。他驻军南阳，却任由反贼从湖北跑到河南，后来出武关，只是从后面追，不知道从前面堵，所以才有了‘迎送伯’的外号。甚至老百姓带着粮食去求他攻打反贼，他都拒绝不要。武官跪下来请求去抓贼，他都不发一兵，因此被参将广福当面讥讽，他反而打击报复。立刻把他抓到京城，依法严惩。
几道命令，雷厉风行，统兵的各级官员都不寒而栗。勒保也只好打起精神，用心筹划，让额勒登保和德楞泰剿灭徐天德、冷天禄，明亮剿灭张汉潮，自己则驻扎在梁山，从中调派。
从嘉庆四年正月到六月，只有额勒登保一路杀了冷天禄。德楞泰一路和徐天德相持，追到了郧阳。
明亮一路，只是在陕西境内奔走，一次胜仗也没打过。勒保虽然有所顾忌，不敢再像以前那样胡扯，但是江山可改本性难移，他还是一看到敌人就腿软，一再推脱。新任的湖广总督倭什布按照实情报告了嘉庆帝，嘉庆帝又下命令：
勒保这半年，一点成就没有，只是各路情形还按时报告。我最近听倭什布汇报说，川贼接连进入湖北，不下两万人，有继续向北逃窜之势。勒保竟然既不堵截，也不围剿，自己跑到一个反贼找不到的地儿，躲起来了，这是第一条罪；他曾多次报告说，不用增兵，却请求拨款五百万，这迫不及待的样子，一看就知道想冒领，这是第二条罪；各路报告，有很多王三槐的余党，勒保却只抓到王三槐，而其他反贼就不闻不问了，这是第三条罪；部队的人都是自己最亲近的人，竟然不按时发军饷，弄得士兵吃不饱肚子，和要饭的一样，这是第四条罪。
勒保对不起人民，对不起国家，更对不起我白花的那些钱。特派尚书魁伦和副都御史广兴去四川把他逮回来治罪！其经略的事务，暂时由明亮代理。
勒保被逮回京城后，永保去担任陕西巡抚。因为明亮剿灭张汉潮一直没奏效，永保怕对自己不利，就举报了明亮。明亮也举报了永保。两人互掐，嘉庆帝就派陕西总督松筠暗地里查访。
松筠报告说：“经略明亮据说很会用兵，说得也头头是道，但却一点实际效果也没有；将军恒瑞以前在湖北，战功最卓越，但现在已经年近六旬，精力大减，恐怕不能胜任；提督庆成，身先士卒，很有胆量，就可惜没什么主见，只能带领偏师，不能深谋远虑；陕西巡抚永保无谋无勇，自私自利，功劳都归给自己，过错就推给别人；只有额勒登保英勇出众，其次是德楞泰，要想平贼，非重用这两人不可。”
于是，朝廷就下令让尚书那彦成带上钦差大臣的大印，到陕西去监督明亮的部队，和松筠一块儿查访。那彦成到达陕西后，仔细询问，得知他们二人相互不和，就和松筠一块儿报告了政府，政府就让人把他俩抓回京城。虽然明亮正好杀了张汉潮，但政府认为功劳不能抵消罪过，仍然让他回京城，并让额勒登保代替担任经略。
额勒登保是满洲正黄旗人，以前是海兰察的部下，讨台湾，征廓尔喀，一直跟着海公建功立业。每次打仗，他都奋勇向前，一马当先。海公曾对他说：“你真是个将才，可惜不识汉字。我有一本兵书，你要熟读，以后一定会成为一代名将。”额勒登保得到这本书，就日夜揣摩，等到熟练后，竟然能出奇制胜。什么书这么厉害？
呵呵！就是本普通的《三国演义》，由汉文译成满文，海公就这么当作宝贝，送给了额勒登保，就像范仲淹授狄青《左氏春秋》一样。额勒登保的手下，有汉将两员，都姓杨，一个叫杨遇春，四川崇庆州人；一个叫杨芳，贵州松桃厅人。
杨遇春梦见神授黑旗，于是就用黑旗率众，敌人一看就知道是杨家军。杨芳好读书，通晓经史大义，因为考试老不及格，所以才弃文从武，被杨遇春赏识，灭掉冷天禄就是二杨的功劳。额勒登保担任经略时，杨遇春已被任命为总兵，杨芳还只是个都司官。额公特地保举杨遇春为提督，杨芳为副将。两人得到提拔，更加拼命效力。就是民兵罗思举和桂涵，也因为额勒登保当了总帅，有功必赏，所以也愿意效力。