福尔伯特很快听说了发生的事情，他错误地断定阿贝拉尔只是想摆脱埃洛伊丝。事实上，阿贝拉尔经常拜访她，他对她的渴望有增无减。有一次，在不可抑制的激情中，他们竟然在奉献给圣母马利亚的修道院餐厅做爱。

返回巴黎后，福尔伯特策划了简单而又残酷的报复。他贿赂阿贝拉尔的贴身男仆给他的追随者打开大门。夜深人静的时候，这些受雇的刺客袭击了阿贝拉尔，用他自己的话说，“用残酷和可耻的手段……割下了阿贝拉尔的生殖器，做出了遭人谴责的行为”。11

哲学家被阉割的消息传播开来。到了早晨，似乎“整个城市”的人都聚集到他家外面为他身体的损毁而痛惜。“惊讶，普遍的不知所措，呻吟，哀号，哭泣——最重要的是他们的怜悯——这些对他的折磨超过他身体的疼痛。”“我会被所有的人指指点点，为人们的嚼舌所撕裂，变成一处怪异的景观。”他感叹道。12

这个受伤的人逃到了巴黎圣丹尼斯的本笃会修道院。他决不会宽恕福尔伯特和他的同伙，他通过法院追逼他们，直到所有人都受到可怕的惩罚。背叛他的男仆和福尔伯特的双眼被挖，生殖器被割掉。福尔伯特的所有财产都被没收。阿贝拉尔甚至还惩罚了埃洛伊丝，迫使她发圣誓，尽管她没有受到召唤也没有兴趣这样做。

埃洛伊丝的朋友和家人恳求她不要采取这种激进的措施。她还是一个年龄只有十几岁的母亲——怎么能自绝于世呢？但是埃洛伊丝对她叔叔在阉割阿贝拉尔一事中所起的作用感到惊骇和愤怒，因此她承诺永远爱阿贝拉尔。她宣称爱阿贝拉尔甚于爱上帝，这让她的家人很震惊。然后，因为阿贝拉尔希望她成为修女，她大步走向祭坛，动情地抽泣，背诵科尼莉娅准备在其丈夫庞培死后自杀的话：“我威严的夫君啊，我为我们的婚姻做得太少，是我导致了这一切吗？我是个罪犯，因为我嫁给你导致了你的不幸!作为赎罪，我现在来接受处罚。”13为了弥补阿贝拉尔失去生殖器和尊严，埃洛伊丝牺牲了自己的自由和未来。

作为一个阉人，阿贝拉尔忽视埃洛伊丝长达10年之久。他再次转向教学和哲学书籍写作。但是这个傲慢的男人却再次与教会里的敌人发生冲突，严重得罪了他的修道士同事，以致他不得不离开修道院，虽然他在学术上仍服从修道院长的规定。阿贝拉尔独自一人住在香槟省的阿杜松(arduzon)河畔，过着隐士超然、禁欲的生活。但是慕名而来的学者们很快找到了他，他们建造了以石头和木材为材料的礼拜堂，后来称作圣灵教堂。

1125年，阿贝拉尔被任命为布列塔尼圣吉尔达斯修道院的院长。搬到那里后，他发现一帮堕落的修道士保持着纳妾的做法，并且将修道院视为他们的领地。修道士们鄙视并恐吓新来的修道院院长，好几次试图杀害他。他们往圣餐期间给他喝的圣酒里投毒。然后又在他的晚餐里下毒，但阿贝拉尔“试食员”的当场死亡，提醒他面临的危险。最后，只是因为一位有同情心的当地贵族的武装干预才使他幸免于难。

在阿让特伊修道院修行的埃洛伊丝是一个不情愿的修女，她日夜思念着阿贝拉尔。随着岁月的流逝，她在修女同事中逐渐变得引人注目，她们中的很多人和她一样对宗教生活方式无动于衷。在她30岁之前，埃洛伊丝成了她所在的女修道院的院长。

埃洛伊丝的修道院不是模范修道院。1125年，她和她姐姐因屡次的放荡行为而被指控有罪。在教廷派驻大使、当地主教和法国国王的命令下，埃洛伊丝和她的修女们被从修道院驱逐出来。但阿贝拉尔的突然出现挽救了她，如今空置的圣灵教堂，给这个无家可归的流浪者提供了一个家。经过10年的沉寂之后，这对恋人重又团聚。

埃洛伊丝仍然不开心地从事着她的职业。时间没有冷却反而烧旺了她的性欲，包括她对阿贝拉尔的性兴趣，尽管他已被阉割。在她安顿好后，阿贝拉尔开始以教堂精神顾问的身份访问圣灵教堂。也许埃洛伊丝无法隐藏对她丈夫的激情，尽管他只对她显出圣爱。也许阿贝拉尔的恃才傲物激怒了那些堕落的修道士。几年后，他们和另外的教士们一起，包括一个很有权力的主教，竟提出不太可能的指控：阉割并没有消除阿贝拉尔的性欲。阿贝拉尔不堪这一指控的羞辱，于是停止访问圣灵教堂。取而代之的是，他和埃洛伊丝迂回曲折地用书信剖析他们的关系、他们爱情的本质和意义。

埃洛伊丝，尽管“被关在一个忧郁的地方”十几年14，但她仍坚决主张自由恋爱，鄙弃唯利是图的婚姻安排，这种婚姻导致女人而不是其丈夫堕落。

阿贝拉尔对他们爱情的后悔折磨着她。“我鄙视妻子的名称，以情妇之名我可能生活得更快乐，”她宣称道。15他是她的上帝、父亲、丈夫和兄弟，如果没有他的爱，生活好像就不值得持续下去。

阿贝拉尔拒绝再次提供保证。相反，他认为自己以前的激情纯粹出于肉体的冲动，他赞美他的被阉割是神赐的礼物，因为它把他从以前摧毁他们俩的熊熊肉欲中释放出来。埃洛伊丝是幸运的，他写道，因为他强迫她进了修道院，她在那里已将“夏娃的诅咒转变成马利亚的祝福”16。当埃洛伊丝得意地回忆他们狂热的性关系时，他写道：“满足你的只是我卑下的欲望，这就是我所有的爱。”17

阿贝拉尔的劝诫信未被理睬。但是在得了一场重病后，埃洛伊丝决定与他断绝关系。“最后，阿贝拉尔，你已永远失去了埃洛伊丝，”她写道，“我不再想你了，我已忘记了你。”18然后，她用一如既往的戏剧性语言，描述她永远不会再看到对女人来说如此性感的阿贝拉尔的富有美感的嘴巴和伟岸的身躯。

在与阿贝拉尔断绝关系后，埃洛伊丝把相当多的精力投入到女修道院院长的工作中。她将圣灵教堂变成了一个模范团体，乐善好施，吸引着全法国敬虔的妇女。随着其学术声望的传播，圣灵教堂还建立了修道院分院。

没有埃洛伊丝的打扰或羞辱，阿贝拉尔试图恢复其神学哲学家的地位。这再一次引发了最终毁了他职业生涯的敌意。1142年4月，彼得·阿贝拉尔去世，大约63或64岁。埃洛伊丝按照他的愿望，将他的遗体送回圣灵教堂，并说服庄重者彼得(peterthevenerable)——一个有同情心的主教，赦免了阿贝拉尔所有的罪。她还用此机会为她的儿子亚斯托雷比安排了教职，亚斯托雷比曾由阿贝拉尔的家人抚养。

埃洛伊丝于1163年或1164年去世。人们把她和阿贝拉尔葬在一起，这也是自他去世以来她最大的愿望。多年来一直有一个传说，是说当她下葬时，他伸出只剩下骸骨的手臂拥抱她。这个传说今天仍能引起人们的共鸣，曾经美丽的埃洛伊丝死后得到了她生前无法得到的东西：永远长眠在她付出太多牺牲的爱人的怀抱中。